Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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