Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP2Q13309 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SKP2Q13309 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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SKP2Q13309 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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