Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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