Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXF2Q12947 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms