Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF2Q12933 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF2Q12933 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF2Q12933 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TRAF2Q12933 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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