Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPN13Q12923 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPN13Q12923 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPN13Q12923 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPN13Q12923 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPN13Q12923 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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