Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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KCNMA1Q12791 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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