Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms