Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXM1Q08050 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms