Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms