Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms