Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms