Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms