Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms