Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms