Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms