Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms