Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDR2Q01850 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms