Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPCQ01831 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms