Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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