Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTBN1Q01082 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms