Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX1P78337 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms