Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HBBP68871 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms