Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms