Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms