Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms