Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP12AP54707 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms