Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIRAP54198 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIRAP54198 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIRAP54198 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms