Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC5A3P53794 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms