Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms