Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA3P52797 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms