Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms