Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A3P48751 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms