Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms