Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms