Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPGP40121 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms