Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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HOXD13P35453 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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HOXD13P35453 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD13P35453 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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