Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF2P35227 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms