Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms