Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC13P31276 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms