Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA7P31268 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms