Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP1P30622 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms