Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO2P25791 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO2P25791 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO2P25791 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms