Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2AP24928 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms