Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms