Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACGP22612 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms