Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms