Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMNB1P20700 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms