Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4AP20648 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms