Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms